Patapon 2 se distingue des autres jeux par son originalité. Comme le premier, le but du jeu est de faire avancer votre armée en rythme par appui sur les touches de la console. Il faut être synchro et ne pas se tromper. On peut noter l'apparition du multijoueur dans cette version qui permet la coopération (réseau local de 2 à 4 joueurs).