Final Fantasy V conte les mésaventures de Bartz qui viendra en aide au Roi de Tycoon afin de protéger les cristaux élémentaires qui détiennent Ex-Death un mage noir dont le dessein n'est autre que la destruction de la vie sous toutes ses formes. Il sera aidé dans sa quête par Lenna, la fille du Roi, Faris un capitaine pirate, Galuf, un vieillard amnésique et d'autres compagnons de route.

Final Fantasy V marque le retour des "Jobs" interchangeables cette fois. Cette édition, uniquement sortie au Japon, comprend les épisodes IV, V et VI.