Le héros de Fragile Dreams : Farewell Ruins of the Moon nommé Seto, se retrouve plongé dans un monde en ruine qu'il devra explorer pour trouver qu'est-ce qui a pu répandre ce chaos. Vous devez le suivre dans sa quête durant laquelle il se mettra à la recherche d'une jeune fille mystérieuse et aux cheveux argentés.